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Sélection actuelle : Toutes les sections
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BCM-2003-A
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Envoyée par : amelie ouellet
Répondue par : Béatrice Roure
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2006-02-17
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Question
#335
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Concernant le compte rendu 2e : il est écrit qu'il faut remettre les fichiers .stat
Or, lorsqu'on a fait le laboratoire, la partie xnqs a été mise de côté. Faut-il (et peut-on) rouler un script afin de vous remettre le fichier .stat ?
Merci  |
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Question consultée 5329 fois. | 4216 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Slim
Répondue par : Béatrice Roure
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2006-01-31
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Question
#334
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Bonjour, j'aurais besoin de quelques précisions concernant la méthode de bootstrap. Nous devons utiliser cette méthode pour determiner l'arbre consensus majoritaire a partir d'une série de 10 arbres non racinés qui connecte 7 espéces différentes (conferer devoir2b pour illustration).
Deux questions se posent alors :
1) La fréquence des bipartions de chaque arbres doit être déterminer; mais doit on se limiter a faire des partitions avec deux et trois especes dedans ou doit on egalement considerer les partitions avec 4 et 5 elements. Si c'est le deuxime cas qui est corret, au sein d'une partition doit distinguer les couples d'especes. Je m'explique: une partition de 4 especes A, B, C et D, ou les especes A et B appartiennent a une branche distincte d'un branche reliant C et D; doit elle etre considerer comme une partion avec les couples (A,B) et (C;D) (qui serait different d'une partition (A,C) et (B,D)) ou comme un ensemble ou les couples des especes n'a aucune importance.
2) Boostrap choisi de facon arbitraire une partition s'il arrive a une etape ou plusieurs partitions peuvent etre utiliser et ayant la meme frequence. Est ce que nous devons choisir egalement une partition sans justifier notre choix dans le devoir, ou au contraire choisir une partition parmi l'ensemble ayant la meme frequence permettant d'obtenir l'arbre consensus majoritaire ayant les partitions les plus frequentes ?
A vrai dire j'ai lu la question #202 mais l'exemple qui y est donne ne m'aide pas beaucoup car on sait que si on a une partition de 3 especes il existe un seul arbre non racine pouvant les regroupes (je suppose que la reponse que vous avez donne concernait des arbres racines). Or avec des partitions de 4 ou 5 especes il existe respectivement 3 et 15 arbres non racines pouvant les rejoindres; donc je considere que les couples ont une grande importance. il y a une reel difference entre realiser des bipartitions dans des arbres non racines et des arbres racines. J'espere donc que pourrait me fournir une reponse concernant les arbres non racines.
Merci d'avance
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Question consultée 5184 fois. | 4145 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2501
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Envoyée par : Étudiant(e) Bioinformatique
Répondue par : Martin Audet
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2006-01-22
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Question
#333
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Bonjour,
dans les corbure beta pour la premiere (classic bulge)est ce que la courbe se trouve au niveau du brin ou il ya un residu en plus? meme chose pour le dexieme g1-bulge et qd est ce qu' on obtient le premier ou le dexieme
merci. |
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Question consultée 5348 fois. | 4262 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2501
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Envoyée par : Étudiant(e) Biochimie
Répondue par : Martin Audet
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2006-01-19
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Question
#331
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Bonjour,
comment distinguer une torsion a droite d'une torsion a gauche?
et aussi pour le type 1 et type 2 de boucle B
et entre g- et g+ et trans
dans les notes de cour partie conformation des proteines a la page 13elle par de liaison t/t et g-/g- mais on voit pas la liaison sur les schema et peut m'expliquer c'est quoi exactement g-/g-?
merci de me repondre. |
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BCM-1521
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Envoyée par : Étudiant(e) Biochimie
Répondue par : Julien Desroches
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2005-12-21
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Question
#330
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Bonjour,
J'ai une problème de vous poser, Je vous remerci à l'avance.
E.coli peut utiliser divers substrats carbonés comme source de carbone et d'énergie.On constate que lorsque les bactéries sont cultivés en présencel'acetate, isocitrate deshydrogenase est très peu active, mais ICDH est activée rapide si on ajoute glucose au milieu. Il y a aussi une diminution rapide de citrate, isocitrate, succinate et malate, mais celui de l'acétyl coA reste inchange.
comment expliquer ce résultat? |
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BCM-3512
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Envoyée par : Étudiant(e) Biochimie
Répondue par : Julien Desroches
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2005-12-18
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Question
#329
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Pouvez-vous m'expliquer la régulation des ions potassiques "inwardly rectifying" par les GPCRs couplés à Gi G0 Gs et Gq? |
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Question consultée 5457 fois. | 4301 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2502
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Envoyée par : Étudiant(e) Biochimie
Répondue par : Julien Desroches
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2005-12-15
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Question
#328
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Je ne comprends pas la notin de gene rapporteur? Voulez vous m'expliquer ?
Merci beaucoup. |
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Question consultée 8607 fois. | 5328 votes, Moyenne 3.2/5.0 |
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BCM-2502
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Envoyée par : Marisol
Répondue par : Julien Desroches
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2005-12-11
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Question
#327
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Bonjour,
J'ai deux questions à vous poser suite à mon étude en vue de l'examen.
La première :
Dans les notes sur l'expression chez les eucaryotes :
"Le enhancer confère souvent l'histo-spécificité à l'expression d'un gène."
Je ne sais pas ce qu'est l'histo-spécificité.
Deuxièmement :
Je me demande ce qui est responsable de l'expression différentielle des gènes
selon les tissus. En effet, tout le génome se retrouve dans toutes les
cellules.
Par exemple, on parle dans les notes de l'élément activateur commun, l'élément
octamère, qui est présent dans le promoteur de plusieurs gènes, entre autres,
celui de l'histone H2B. Il active l'expression de ce gène durant la phase S
lorsque le facteur Oct-1 le lie. Ce facteur se retrouve dans toutes les
cellules.
(Jusqu'ici ça va.)
Mais l'élément octamère est aussi dans le promoteur du gène de la chaîne légère
de l'immunoglobine kappa. Dans ce cas-ci, c'est le facteur Oct-2 qui est
responsable de l'activation, bien que Oct-1 soit présent. Ce gène n'est actif
que dans les lymphocytes.
Tout ceci pour vous demander, comment ça se fait que le facteur Oct-2 n'est pas
dans toutes les cellules ? De façon générale, si toutes les cellules ont le
même génôme, elles ont toutes les mêmes gènes, donc les mêmes promoteurs, les
mêmes éléments activateurs, inhibiteurs, communs et spécifiques. Les mêmes
protéines, facteurs qui se lient à ces éléments. Comment certains gènes sont
activés dans certaines cellules alors ??
Merci. |
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Question consultée 5889 fois. | 4371 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-3512
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Envoyée par : Frédéric
Répondue par : Marie-Claude Sincennes
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2005-11-29
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Question
#322
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J'aimerais savoir quel(s) évènement(s) moléculaire(s) cause(nt) la phosphorylation de FAK sur son résidu tyrosine 397 dans les voies de signalisations reliées à la motilité cellulaire et l'attachement des cellules à la matrice extracellulaire. |
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Question consultée 5597 fois. | 4407 votes, Moyenne 3/5.0 |
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