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Espace Étudiants : Banque de Questions/réponses

Sélection actuelle : BCM-2003-A Sélectionner : Toutes les sections BCM - Questions générales BCM-1501-A Section générale- Origine biochimique de la vie BCM-1502 Métabolisme I BCM-1503 Acides nucléiques et génétique 1 BCM-1521 Partie Théorique-Travaux pratiques de biochimie 1 BCM-2501 Protéines BCM-2504 Enzymologie BCM-3514 Régulation de l'expression génique GEN - BIBLIO Recherche Bibliographique Rechercher le mot : ou le # de Question : Il y a 1 éléments répertoriés.  Précédent | 1 | Suivant
BCM-2003-A Envoyée par : dévice djomo Répondue par : Jean-Christophe Grenier 2009-02-11 Question #510 bonjour, j'aimerais savoir si nous devons utiliser la fonction gamma et éliminer les caratères non informatives pour le calcul du bootstrap. Merci Réponse Oui, comme dit dans l'un de mes mails, il s'agit de remplir les informations de la diapositive #14 avec deux colonnes de plus, donc avec GTR+Gamma et GTR+GAMMA+ Enlever non-informatifs pour le jeu mitochondrial. Il s'agit donc de faire 8 arbres de bootstrap en tout. Puisque vous deviez faire également un test avec le jeu contenant seulement le Zinc finger avec le modèle GTR, il serait bien de comparer cet arbre avec les deux autres (CYTb , Mito). Pour que le bootstrap fonctionne convenablement pour le fichier n_1gene, je vous conseille d'enlever les séquences vides (contenant seulement des N). De cette façon, vous n'aurez plus (ou presque plus) de message d'erreur concernant la reconstruction. Informations Question consultée 5800 fois. | 4711 votes, Moyenne 3/5.0 | À vous de voter => min max
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