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BCM-2003-A
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Envoyée par : Étudiant(e) Bioinformatique
Répondue par : Béatrice Roure
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2008-02-12
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Question
#476
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Bonjour, j'ai quelques questions sur le devoir1c.
Pour le tableau Bootstrap...je ne comprend pas ce qu'il faut faire:
Premierement, d'ou voulez-vous qu'on prenne les "3 noeuds intéressants pour étudier les liens de parenté entre les groupes monophylétiques"?
Deuxiemement, quelles sont les valeurs que nous devons mettre dans le tableau?
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Finalement, a la page 21, quand vous demandez "Regarder maintenant la taille de la branche finale du Gnetum". Dans quel arbre voulez-vous qu'on regarde? (i.e. quel jeu, quel critere et quel modele).
Merci!
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Réponse
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Bonjour,
Bootstrap: il s'agit des noeuds internes qui ont été proposés lors du 2eme TP de phylogénie et qui permettent de positionner les groupes monophylétiques les uns par rapport aux autres. Les valeurs sont celles retournées par les tests de bootstrap pour chaque inférence (voir page 10 de l'énoncé 3 ou dans le cours magistral)
Gnetum: la question faisant suite à la question sur la taille des arbres page 20, il faut donc utiliser l'inférence qui donne les meilleures valeurs pour les longueurs de branches
Béatrice
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