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BCM-2003-C
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Envoyée par : Étudiant(e) Bioinformatique
Répondue par : Mathieu Courcelles
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2008-04-02
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Question
#478
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Bonjour Mathieu,
J'ai beau essayer avec deux autres étudiants à comprendre comment analyser manuellement les spectres MS/MS (sans se baser sur une méthode d'essaies/erreurs à l'aide de la séquence de la protéine), mais sans succès.
Nous avons trouvé un tutoriel en ligne à l'adresse suivante :
http://www.ionsource.com/tutorial/DeNovo/protocol.htm
mais nous ne comprenons pas comment calculer la valeur de (M+H)1+, qui correspond en fait si nous avons bien compris au poids total du peptide. En effet, dans l'exercice proposé par l'auteur, cette donnée est toujours présente. Par la suite, il suffit de calculer les valeurs soit en suivant la série b ou y.
est-ce que tu pourrais nous aider un peu,
merci
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Réponse
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L'information pour calculer le (M+H)1+ est glissée dans les notes d'Hervé mais elle n'est pas généraliser. La formule est m/z = (M+zH) / z . Je vous ai donné la valeur m/z et z pour chaque spectre et donc vous pouvez calculer la valeur (M+H)1+.
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