Envoyé par : A. Nom Nîmes
Répondu par : Mathieu Courcelles
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2009-04-08 |
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Bonsoir,
À quelle genre de variance devrions-nous nous attendre entre deux fichiers de résultats provenant du même fichier d'origine (phospho-large.mgf)? En d'autres mots, si par hasard un certain esprit de collaboration étudiante faisait en sorte qu'on remarquait des différences considérables entre les nombres de phosphoprotéines (et de phosphopeptides) et que cette différence n'était pas due à des différences au niveau des manipulations, qu'en diriez-vous? Mascot emploie un modèle probabiliste, donc j'en déduit que la propriété de non reproductibilité est attendue, mais avec une variance de quel ordre? Merci, Anonyme |
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Je suis surpris qu'il y est une si grande différence. Mascot utilise un modèle probabiliste pour calculer le score. Par contre la recherche et les résultats devraient être consistant d'un essai a l'autre si les paramètres sont les mêmes. Il est assez facile d'oublier un paramètre. |
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