Envoyé par : Patrick
Répondu par : Jean-Christophe Grenier
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2009-02-02 |
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Bonjour !
J'aurais une question concernant le devoir 1b, sur la question a la page 27 du document. Quand j'essaie de faire une inference avec la commande >nj brlens=yes sur les donnees proteiques des trois autres fichiers ( CYTb_prot.nex, mito.nex, noyau.nex ), j'obtient la reponse suivante : Error(#701): The distance requested (Jukes-Cantor) requires nucleotide (DNA/RNA) data. J'ai prealablement changer le fichier en format nexus, et j'utilise les parametres : >set criterion=distance >dset dist=jc Est-ce que vous avez une idee pourquoi sa ne fonctionne pas ? Merci ! |
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Je peux répondre à la question de la façon suivante : de quel type est votre fichier d'alignement et quel genre d'erreur le programme vous envoit-il? Vous faites la manipulation de la bonne façon, c'est donc la bonne sortie que vous obtenez.
"Error(#701): The distance requested (Jukes-Cantor) requires nucleotide (DNA/RNA) data." Tout est dans cette ligne. Il ne vous reste plus qu'à en discuter dans votre rapport. |
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