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Espace Étudiants : Banque de Questions/réponses

Sélection actuelle : BCM-2003-C Sélectionner : Toutes les sections BCM - Questions générales BCM-1501-A Section générale- Origine biochimique de la vie BCM-1502 Métabolisme I BCM-1503 Acides nucléiques et génétique 1 BCM-1521 Partie Théorique-Travaux pratiques de biochimie 1 BCM-2501 Protéines BCM-2504 Enzymologie BCM-3514 Régulation de l'expression génique GEN - BIBLIO Recherche Bibliographique Rechercher le mot : ou le # de Question : Il y a 1 éléments répertoriés.  Précédent | 1 | Suivant
BCM-2003-C Envoyée par : Patrick Répondue par : Mathieu Courcelles 2009-04-08 Question #523 Bonjour ! La question est en rapport avec le devoir 3b. Se serait pour savoir si c'était possible d'avoir des précisions sur la formule pour calculer le nombre de faux positifs. Effectivement, de ce que j'ai compris nou obtenons pour la liste de peptide un certain nombre de séquences ( ex : ALSNLSAKD ) qui sera égale au total hit. Pour ce qui est du decoy hits, je pense qu'en classe nous avions parlé à ce moment d'utiliser les r-IPI. Par contre cela correspondrait plus aux protéines qu'aux peptides et je suis donc un peu perdu. Merci ! Réponse Pour calculer les faux positifs, il faut savoir le nombre total de peptides DISTINTS identifiés et le nombre de peptides DISTINTS identifiés dans la base de données renversée (donc les hits avec r-IPI). Un peptide distint est une paire unique de séquence et de modifications. Pour les decoy hits, filtrer d'abord les protéines identifiés avec r-IPI et ensuite compter les peptides distints. Informations Question consultée 6052 fois. | 4804 votes, Moyenne 447019.9/5.0 | À vous de voter => min max
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