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Espace Étudiants : Banque de Questions/réponses

Sélection actuelle : BCM-2003-B Sélectionner : Toutes les sections BCM - Questions générales BCM-1501-A Section générale- Origine biochimique de la vie BCM-1502 Métabolisme I BCM-1503 Acides nucléiques et génétique 1 BCM-1521 Partie Théorique-Travaux pratiques de biochimie 1 BCM-2501 Protéines BCM-2504 Enzymologie BCM-3514 Régulation de l'expression génique GEN - BIBLIO Recherche Bibliographique Rechercher le mot : ou le # de Question : Il y a 1 éléments répertoriés.  Précédent | 1 | Suivant
BCM-2003-B Envoyée par : Diala ABD RABBO Répondue par : Jean-Philippe Laverdure 2005-02-25 Question #221 Bonjour, J'ai remarqué que dans RMAExpress, après détermination du fichier (HG_U95Av2.cdf) et des fichiers Cel normaux, j'ai obtenu cette notice affichée: 'Reading in data Opening CDF and CEL files Mismatch in CDF names. Found:HG-U133_Plus_2 Expecting: HG_U95Av2 in the file PA-N_112-1.cel' et j'aurais pas la possibilité de faire 'Add New Cel Files' je pense qu'il y a peut être une erreur dans PA-N_112-1.cel. Tout à noter que j'ai retéléchargé les cel files. Par contre, j'ai essayé de faire la même procédure mais avec le ficher HG-U133_Plus_2.cdf et ca très bien marché (avec les mêmes fichiers cel) Je vous ai copier le fichier log: Welcome to RMAExpress Written by B. M. Bolstad Version: 0.3 Release ............ Starting Analysis ............. Select CDF file CDF file : HG_U95Av2.CDFin C:\Documents and Settings\DUVAL\Mes documents\Biochimie\University\BCM 2003 Application d`outils Bioinformatiques\Transcryptonomy - Sylvain Foisy\Full\HG_U95Av2\LibFiles ............. Select CEL files CEL files : PA-N_112-1.cel CEL files : PA-N_118.cel CEL files : PA-N_148.cel CEL files : PA-N_200.cel CEL files : PA-N_249.cel CEL files : PA-N_291.cel CEL files : PA-N_294.cel CEL files : PA-N_300.cel CEL files : PA-N_322.cel CEL files : PA-N_325.cel CEL files : PA-N_326.cel CEL files : PA-N_5.cel Reading in data Opening CDF and CEL files Mismatch in CDF names. Found:HG-U133_Plus_2 Expecting: HG_U95Av2 in the file PA-N_112-1.cel Merci. Réponse Bonjour, En effet, il semble y avoir un probleme ! Il semble que ma derniere reponse n'ait pas ete assez claire... desole ! En gros: le fichier que je vous ai founis expliquant les manipulations des logiciels RMAExpress et TMeV a ete ecrit pour une autre formation dans laquelle nous utilisions des donnees recueillies a l'aide d'un chip Affy de type HGU95Av2 contrairement au jeu de donnees que nous vous avons fournis pour ce TP (chip Affy HG U133 plus 2.0) Voila pourquoi ca fonctionne avec le CDF HG U133 plus 2.0!! (parce que c'est celui qui correspond au format des donnees d'hybridation que nous vous faisons manipuler...) Comme j'ai dit auparavent, n'utilisez le fichier PDF qu'en tant que guide d'utilisateur pour les logiciels... Et faites abstraction du jeu de donnees qui y est presente ! Bon courage ! Informations Question consultée 5717 fois. | 4561 votes, Moyenne 3/5.0 | À vous de voter => min max
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