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Sélection actuelle : Toutes les sections
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Ousmane Diallo
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-05
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Question
#241
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Apres avoir fait le clustering avec K-means, comment on fait pour recuperer la liste de probsets??  |
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Question consultée 5117 fois. | 4063 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Ousmane Diallo
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-05
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Question
#240
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Pour le rapport du devoir 3, est-ce qu'on doit decrire de maniere detaillee la technique utilisee pour chaque etape de la manipulation, ou bien on doit donner seulement les grandes lignes de ce qu'on a fait? |
| Informations |
Question consultée 5262 fois. | 4106 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Jean-Philippe Laverdure
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-05
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Question
#235
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Quelques questions d'autres etudiants... |
| Informations |
Question consultée 5132 fois. | 4025 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Jean-Philippe Laverdure
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-04
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Question
#232
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Un etudiant a pose la question suivante face au devoir 3:
Est-ce que tu pourrais donner plus de détails comment procéder à l'étape 6 et 7. Merci
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| Informations |
Question consultée 5162 fois. | 4037 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Ousmane Diallo
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-04
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Question
#231
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Bonjour,
Pour le devoir 3, je parviens pas a trouver le fichier .CDF dans le site d'Affymetrix. Pouvez-vous m'indiquer ou il se trouve sur le site?
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| Informations |
Question consultée 5116 fois. | 4060 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Véronique Lisi
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-03
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Question
#230
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Bonjour,
Si on utilise MotifSampler à partir de Toucan, on aimerait des valeurs "sig" de plus de 2 pour avoir un motif vraiment sur représenté. Si on utilise MotifSampler comme programme externe, que doit-on considérer comme une bonne valeur puisqu'on obtient
Consensus score
Information content
Loglikelihood score
comme output.
Merci |
| Informations |
Question consultée 5260 fois. | 4138 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-1521
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Envoyée par : Johanna Sandoval
Répondue par : Julien Desroches
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2005-02-27
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Question
#223
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La pronase et la protéinase K sont-elles la même chose?
Merci
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| Informations |
Question consultée 6158 fois. | 4295 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Jean-Philippe Laverdure
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-02-26
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Question
#222
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Un étudiant a demande plus de details sur la structure du chip Affymetrix. La voici...
(les questions sont en italique) |
| Informations |
Question consultée 5478 fois. | 4062 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Diala ABD RABBO
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-02-25
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Question
#221
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Bonjour,
J'ai remarqué que dans RMAExpress, après détermination du fichier (HG_U95Av2.cdf) et des fichiers Cel normaux, j'ai obtenu cette notice affichée:
'Reading in data
Opening CDF and CEL files
Mismatch in CDF names. Found:HG-U133_Plus_2 Expecting: HG_U95Av2 in the file PA-N_112-1.cel'
et j'aurais pas la possibilité de faire 'Add New Cel Files' je pense qu'il y a peut être une erreur dans PA-N_112-1.cel. Tout à noter que j'ai retéléchargé les cel files.
Par contre, j'ai essayé de faire la même procédure mais avec le ficher HG-U133_Plus_2.cdf et ca très bien marché (avec les mêmes fichiers cel)
Je vous ai copier le fichier log:
Welcome to RMAExpress
Written by B. M. Bolstad
Version: 0.3 Release
............
Starting Analysis
.............
Select CDF file
CDF file : HG_U95Av2.CDFin C:\Documents and Settings\DUVAL\Mes documents\Biochimie\University\BCM 2003 Application d`outils Bioinformatiques\Transcryptonomy - Sylvain Foisy\Full\HG_U95Av2\LibFiles
.............
Select CEL files
CEL files : PA-N_112-1.cel
CEL files : PA-N_118.cel
CEL files : PA-N_148.cel
CEL files : PA-N_200.cel
CEL files : PA-N_249.cel
CEL files : PA-N_291.cel
CEL files : PA-N_294.cel
CEL files : PA-N_300.cel
CEL files : PA-N_322.cel
CEL files : PA-N_325.cel
CEL files : PA-N_326.cel
CEL files : PA-N_5.cel
Reading in data
Opening CDF and CEL files
Mismatch in CDF names. Found:HG-U133_Plus_2 Expecting: HG_U95Av2 in the file PA-N_112-1.cel
Merci. |
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Question consultée 5292 fois. | 4206 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2504
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Envoyée par : Josée Frappier
Répondue par : Alexandre Viau
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2005-02-25
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Question
#220
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J'ai de la difficultée à déterminer le raisonnement menant aux deux dernières colonnes des tableaux des pages 33 et 34 des notes de cours. Quelle est la différence entre les tirets et pas d'inhibitions ?
l'examen est demain à 17h,
Josée
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Question consultée 5185 fois. | 4103 votes, Moyenne 3/5.0 |
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