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Sélection actuelle : Toutes les sections
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BCM-2003-C
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Envoyée par : diala abd rabbo
Répondue par : Mathieu Coinçon
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2005-04-06
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Question
#265
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Bonjour Prof.,
dans l'exercice 1, vous demander de calculer la force en x sur i et j en prenant l'énergie trigonométrique, c'est à dire l'énergie donnée par la formule 6 en remplacant le cos de tétta par sa valeur donnée par la formule 7, or ce que vous avez fait en classe n'était pas ca car vous avez utilisez la formule E = 1/2 . K . carré(rij-r0) et vous n'avez pas remplacé les cos par leur valeur. Je me demande si j'ai raison et qu'il faut considérer ce que vous avez fait en classe était juste un exemple et c'est à nous de faire l'exercice en employant l'énergie trigonométrique. Si je me trompe comment avait vous arriver à l'équation E = 1/2 . K . carré(rij-r0) en partant de la formule 6.
Merci
Merci  |
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Question consultée 5132 fois. | 4110 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-C
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Envoyée par : Lilianne
Répondue par : Mathieu Coinçon
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2005-04-01
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Question
#264
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Bonjour, j'effectue:
pdb2gmx -f epingle.pdb -o epingle.gro -p epingle.top
Choix du champ de force : #2 : GROMOS96 43a2 forcefield (development) improved alcane dihedral
Après quelques analyses, le programme me donne un message d'erreur "Warning: 'AR 1 not found in residue topology database, trying to use 'AR'
Puis c'est une erreur fatale, car il ne trouve par HN1 in residue AR...bla bla... maybe different protonation state.
?? |
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BCM-2504
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Envoyée par : Ousmane
Répondue par : Alexandre Viau
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2005-03-25
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Question
#263
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Bonjour,
Je ne comprends pas les figures expliquant l'influence de la Boucle d'Occlusion sur les Activités Endo- et Exo- Peptidase de la Cathepsine B...
(3. Section - 3 page 9)
Pouvez-vous m'éclairer un peu plus cette partie?
Merci!! |
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BCM -
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Envoyée par : Abdulkerim Hassen
Répondue par : Alexandre Viau
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2005-03-24
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Question
#262
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Bonjour je voudrais avoir plus d'information sur la technique:
Primer extension analysis.
C'est-à-dire comment elle fonctionne et ça sert à quoi. |
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Question consultée 5489 fois. | 4188 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Steve
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-13
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Question
#257
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Pour preparer les donnees pour utiliser avec GenMapp je l'ai fais EXACTEMENT comme dans le pdf que tu as laisser en-ligne.. GenMapp trouve aucune erreurs dedans..c'est pourquoi je t'ai demander d'ecrire les etapes que on a suivi en classe...
Tu as eliminer la moitie des details...tu as laisser seulement les trois colonnes ( deux A et une B) plus le probeset id et une colonne des 'X's c'est vrai?Combien de rangees doit je avoir? J'ai eliminee tous les vergules.
Ca fonctionne en classe mais pas ici.
Pour le devoir pourriez vous me donner une indice comment combiner Affymetrix et 2spot array... parce que j'ai fais beaucoup de recherche en ligne sur des techniques de transcriptomique et j'en ai pas trouver qqn qui utilise les deux ensembles. Ils font plus ou moins la meme chose.
Merci pour votre temps. |
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Question consultée 5083 fois. | 4021 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Ousmane
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-13
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Question
#256
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Bonjour,
quand je download les fichiers sur genMAPP, je ne recois pas les fichiers indiqués sur le document pdf des détails de manips (Hs_MAPP_Archive_20040426, Hs-Std_20040614) mais je recois plutot les fichiers suivants:
Hs-Std_20041021 et Hs_MAPP_Archive_Contributed_20041216
Ca me donne 2757 erreurs avec le significant.txt
Et apres avoir fait Process Exceptions ca me donne toujours le meme nombre d'erreurs!!!
Que dois-je faire???
Merci des éclaircissements... |
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Question consultée 4886 fois. | 3900 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : L Steve
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-13
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Question
#255
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J'ai pas compris les directions dans le devoir deux.
Qu'est-ce que ca veux dire de commencer avec un experiment in vitro?
Dans la demarche je dois utilser les deux technolgies (Affy et Micro Array) ou je puisse utiliser seulemet une.
merci |
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Question consultée 5172 fois. | 3987 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Véronique Lisi
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-13
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Question
#254
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Bonjour,
Quand on dit que Anova performe mieux avec un nombre limité de réplicat, on considère faible comme étant combien environ? 5, 10, 25, plus?
Merci |
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Question consultée 5043 fois. | 3914 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Steve
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-13
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Question
#253
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Pour le devoir 3 addendumm
j'ai modifie le fichier de genes significatifs comme demontrer dans le document de manipulation GenMapp mais je ne trouve pas 16 erreurs.
Je l'ai modifie en classe.
Je sais que je suis pas le seul
Je l'ai fais de 5 facons differentes..aucun facon fonctionne
Peut me donner les etapes a suivre pour modifier le fichier de donnnes comme-il-faut s.v.p
MERCI! |
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Question consultée 5222 fois. | 4142 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-B
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Envoyée par : Jean-Philippe Laverdure
Répondue par : Jean-Philippe Laverdure
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2005-03-13
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Question
#252
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Quelques questions face au devoir 3... |
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Question consultée 5088 fois. | 4017 votes, Moyenne 3/5.0 |
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