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BCM-2003-C
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Envoyée par : Étudiant(e) Bioinformatique
Répondue par : Mathieu Courcelles
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2009-04-08
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Question #524
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À quoi correspond la liste de "Unassigned Peptides" à la fin du rapport de MASCOT ?
Faut-il ignorer ces résultats dans notre analyse ?
Merci |
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Réponse
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C'est la liste des peptides que Mascot a trouvé mais qu'il n'a pas eu une confiance suffisante pour l'assigné a une protéine. Généralement ces résultat sont ignorés car ils ne sont pas de confiance mais parfois on regarde quand même cette liste lorsque l'on cherche quelque chose de particulié qui aurait un spectre de mauvaise qualité.
Je vous laisse libre de l'inclure ou pas. Spécifier dans le rapport. Le taux de faux positifs devrait être plus élevé si vous les incluez.
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