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Sélection actuelle : BCM-2003-A

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BCM-2003-A Envoyée par : Patrick Répondue par : Jean-Christophe Grenier 2009-02-02
Question
#497
Bonjour !
J'aurais une question concernant le devoir 1b, sur la question a la page 27 du document. Quand j'essaie de faire une inference avec la commande
>nj brlens=yes
sur les donnees proteiques des trois autres fichiers ( CYTb_prot.nex, mito.nex, noyau.nex ), j'obtient la reponse suivante :

Error(#701): The distance requested (Jukes-Cantor) requires nucleotide (DNA/RNA) data.

J'ai prealablement changer le fichier en format nexus, et j'utilise les parametres :

>set criterion=distance
>dset dist=jc

Est-ce que vous avez une idee pourquoi sa ne fonctionne pas ?
Merci !
Réponse Je peux répondre à la question de la façon suivante : de quel type est votre fichier d'alignement et quel genre d'erreur le programme vous envoit-il? Vous faites la manipulation de la bonne façon, c'est donc la bonne sortie que vous obtenez.

"Error(#701): The distance requested (Jukes-Cantor) requires nucleotide (DNA/RNA) data."

Tout est dans cette ligne. Il ne vous reste plus qu'à en discuter dans votre rapport.

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