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BCM-2501
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Envoyée par : GUINDO
Répondue par : Martin Audet
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2007-02-22
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Question #430
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SVP,J'ai du mal à calculer le PHi de ce peptide manuelement (sans passer par un logiciel). J'aimerai avoir un de pouce.
Composition d'un peptide est P W K A 2L 2Y V 2S 2R T 2N Q H
quelle sa charge globale et son point isoélectrique.
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Réponse
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Pour trouver le point isoelectrique, tu dois d'abord dessiner la cascade d'ionisation du peptide à l'aide des pK des chaînes latérales des résidues ionisables (acide aminée à chaîne latérale polaire chargée p.59 de l'ancienne version du Voet et Voet) et des pk des groupements n-terminal et c-terminal de ton peptide. Ensuite, identifie la forme neutre globale de ton peptide dans ta cascade d'ionisation. Tu pourras calculer le point isoelectrique en additionnant les pk de chaîne latéral se retrouvant de part et d'autre de la forme neutre dans la cascade d'ionisation et en divisant la réponse par 2.
pI = (pk1 + pk2)/2
Evidemment, pour calculer la charge globale tu as besoin du pH de la solution
Martin
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